1、直接杀死精子。附睾被病原体感染后，部分病原体（如大肠杆菌）可直接损害附睾管内的精子，抑制精子的活动或凝结精子，以降低其活动能力；一些病原体（如支原体和衣原体）吸附在精子表面，从而减少甚至丧失其活动能力。病原体产生的毒素也会毒害脆弱的生精子，大大提高其死亡率。同时，白细胞、巨细胞等身体卫士在消灭病原体时，也可能无论如何都会误杀或误伤精子。炎症反应产生的大量代谢物也会毒害精子或改变精子的生活环境，降低精子活动能力，增加死精子，导致精子畸形率上升，精子数量减少。

  2、阻断精子的行走通道。如果附睾炎是由淋球菌、结核杆菌、支原体、衣原体等病原体感染引起的，不仅会发生炎症反应，损害精子，还容易导致附睾管腔缩小或堵塞，导致附睾尾部与输精管连接处不完全或完全梗阻。这是一种不可逆转的附睾炎后遗症。精子被堵塞在附睾管内，无法排出。它只能慢慢困死或屠宰，导致阻塞性少精子症或无精子症。

  第三，容易产生精子抗体。附睾炎也是男性形成抗精子抗体的重要原因。当附睾发炎时，身体的自卫系统会立即行动。白细胞、淋巴细胞等免疫细胞和体液免疫物质进入炎症附睾管，清除病原体，形成医学上提到的免疫反应和免疫细胞。同时，免疫细胞对自身组织的识别能力明显降低，直接与精子表面或精浆中的抗原物质发生免疫反应，形成抗精子抗体。
         睾丸炎除了引起不孕，睾丸炎作为一种炎症，可以直接威胁邻近器官，如果在身体免疫力低下，其他特殊时期，可能直接引起炎症传播，从而引起其他炎症疾病，在这种情况下，无疑给治疗带来了一定的困难。